科学自由研究に興味を持った全国の中・高校生（個人、グループ）を対象に、希望する研究計画を募集しています。専門委員による書類審査・一次面談審査を通過した生徒（メンティ）は、該当分野の専門研究者（大学、研究所など）の指導で研究計画を作成します。その後に行う二次審査により20 件程度を採択し、メンターによる研究指導を6 か月以上（メンティの希望により）行って、科学研究の基礎を教育します。毎年、海洋分野の研究計画を採択しています。